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URN: urn:nbn:de:bsz:25-opus-30145
URL: http://www.freidok.uni-freiburg.de/volltexte/3014/


Klauenberg, Katy

A semi-automatic procedure for the evaluation of tooth cementum annulation images for paleodemographic studies

Ein halbautomatisches Verfahren zur Auswertung von TCA-Aufnahmen für paleodemografische Untersuchungen

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Kurzfassung in Englisch

Tooth Cementum Annulation (TCA) images are microscopic images from the root of human teeth. These digital images display annual incremental lines which can be used for age estimation. Until now, the incremental lines (or tooth rings) have been counted manually from under the microscope or on the (digital) TCA image. Since research using the manual observations led to contradictory results, algorithms to automatically evaluate TCA images are considered a crucial step towards computer-assisted TCA age estimation.

TCA images can be evaluated based on measuring their features, but until now no statistical model was developed. In this work, TCA images are modeled as hidden Markov random fields, because these models can incorporate prior knowledge about tooth rings and are thereby able to imitate human vision. In particular, the Markov random field is specified by the FRAME model which incorporates filter responses to the label image into the Gibbsian distribution and is thus able to take into account long-range dependencies among the observed values and periodicity in the placement of tooth rings. The estimation of model parameters is rendered possible via an EM algorithm. This coherent approach is developed step-by-step and tested extensively throughout this work.

Kurzfassung in Deutsch

Zahnzementannulation (TCA) ist der Prozess der geschichteten Bildung von Zahnzement an der Wurzel von Zähnen und kann bei Menschen zur Schätzung des Individualalters genutzt werden. Hierzu werden mikroskopische Aufnahmen von dünnen Querschnitten der menschlichen Zahnwurzel angefertigt (sogenannte TCA-Aufnahmen), in denen die vermutlich jährlich gebildeten Zuwachslinien als dunkle und helle Bänder erscheinen. (Kagerer and Grupe [2001]) Bisher wurden die dunklen Zuwachslinien (Zahnringe) optisch am Mikroskop oder am (digitalen) Bild ausgezählt, um eine Altersschätzung abzuleiten. Ein Algorithmus zur automatischen Auswertung der TCA-Aufnahmen ist von großer Bedeutung, da Forschungsarbeiten, die manuelle Zählungen verwendeten, zu widersprüchlichen
Resultaten führten.

In der vorliegenden Arbeit wurde das erste Modell-basierte Verfahren zur Auswertung von TCA-Aufnahmen entwickelt. Hierzu wurden TCA-Aufnahmen als sogenanntes 'hidden Markov random field' modelliert, welches weitreichende Abhängigkeiten der beobachteten Grauwerte mithilfe eines Filter-basierten Modells einbezieht. Dieses Modell kann menschliches Sehen nachahmen, indem es die periodische Platzierung der Zahnringe nachbildet. Die Anwendung auf TCA-Aufnahmen erzielte konkurrenzfähige, zum Teil sogar bessere, Ergebnisse verglichen mit den manuellen Schätzungen. Diese Arbeit stellt daher ein wertvolles Hilfsmittel dar für weitere anthropologische sowie paläodemografische Forschungsarbeiten an und mit der TCA-Methode.

SWD-Schlagwörter: EM-Algorithmus , Gibbs-Verteilung , Markov-Feld
Freie Schlagwörter (deutsch): FRAME , (hidden) Markov random field , Mittelfeld-Näherung, TCA
Freie Schlagwörter (englisch): EM, FRAME, Gibbs distribution, (hidden) Markov random field, mean field approximation, TCA
Institut: Institut für Informatik
Fakultät: Fakultät für Angewandte Wissenschaften
DDC-Sachgruppe: Informatik
Dokumentart: Dissertation
Hauptberichter: Burkhardt, Hans (Prof. Dr.)
Sprache: Englisch
Tag der mündlichen Prüfung: 12.03.2007
Erstellungsjahr: 2007
Publikationsdatum: 13.08.2007
Bemerkung: This dissertation was supported by the Max Planck Institute for Demographic Research in Rostock. Related Publications: - Streso, K. and Lagona, F. (2006). Hidden Markov Random Field and FRAME Modelling for TCA Image Analysis. Proceedings of the Third IASTED International Conference on Signal Processing, Pattern Recognition, and Applications, 310-315. - Klauenberg, K. and Lagona, F. (2007). Gabor Filters in Hidden Markov Random Field Models for TCA Image Analysis. Computational Statistics and Data Analysis, 2nd Special Issue on \'Statistical Signal Extraction and Filtering\', to appear.
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