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Bitte beziehen Sie sich beim Zitieren dieses Dokumentes immer auf folgende
URN: urn:nbn:de:bsz:25-opus-7221
URL: http://www.freidok.uni-freiburg.de/volltexte/722/


Fischer, Marcus Alexander

Quantitative Bestimmung der 9-minus-Splice-Varante in CFTR-mRNA aus Rektumschleimhautbiopsie und deren Abhängigkeit von der Länge des Poly-T-Traktes in Intron 8 des CFTR-Gens

Quantitative analysis of exon 9 splicing patterns in CFTR mRNA transcripts in rectum epithelium

Dokument1.pdf (497 KB) (md5sum: 3df0787935fe84f7455b8f768a82a4cc)

Kurzfassung in Deutsch

In dieser Arbeit wurde der Einfluss des TGmTn-Polymorphismus in Intron 8 des CFTR-Gens auf das Fehlspleißen des Exon 9 der CFTR-mRNA in Rektummukosabiopsien von 26 Probanden untersucht. Dem ermittelten Genotyp wurde der mittels neu etablierter semiquantitativer RT-PCR bestimmte Anteil an korrekt (9-Plus) und fehlgespleißter (9-Minus) CFTR-mRNA gegenübergestellt und es zeigte sich eine Zunahme des Fehlspleißes mit abnehmender Länge des Poly-T-Traktes. Weiterhin fand eine Genotyp-Phänotyp-Korrelation durch allelspezifische Expressionsanalysen und eine Gegenüberstellung mit elektrophysiologischen Befunden aus Untersuchungen in der Ussing-Kammer statt. Hier zeigte sich eine krankheitsmodulierende, bzw. auslösende Bedeutung des Poly-T-Polymorphismus.


Kurzfassung in Englisch

The amino terminal NBF, a 154 residue domain coded by exons 9-12 is belived to play a critical role in the function of the CFTR ptotein. The initial 21 of NBF1 are coded by the 183 bp exon 9. We examinated for the first time the influence of the polymorphic (TG)mTn locus in intron 8 on deletion of exon 9 in CFTR mRNA transcripts in rectum epithelium of CF (Cystic fibrosis) and non-CF individuals.
We found a significant correlation with the amount of 9+ CFTR mRNA and the length of poly Tn locus.
The association with the clinical manifestation of CF could also be demonstrated.


SWD-Schlagwörter: Mukoviszidose , RNS-Spleißen , Rektumbiopsie , Genotyp , Phänotyp
Freie Schlagwörter (deutsch): 9-minus-Splice-Varinte , Poly-T-Trakt , Exon 9 , Polymorphismus
Freie Schlagwörter (englisch): CFTR , CF , mRNA , splicing pattern , rectum epithelium
Institut: Univ.-Kinderklinik
Fakultät: Medizinische Fakultät / Universitätsklinikum (bis Sept. 2002)
DDC-Sachgruppe: Medizin und Gesundheit
Dokumentart: Dissertation
Erstgutachter: Kühr, Joachim (PD Dr.)
Sprache: Deutsch
Tag der mündlichen Prüfung: 28.02.2003
Erstellungsjahr: 2003
Publikationsdatum: 16.06.2003
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